寫作化學論文,少不了要作圖,尤其是發表對圖表要求篇幅比較長的期刊。然而,用什么軟件做的三維結構圖才能高質量地展現真實的晶體結果或數據,依舊是個大難題。本文推薦7個化學論文的作圖軟件。
1)Materials Studio
Materials Studio是專門為化學、材料科學領域研究者開發的一款可運行在電腦端的模擬軟件,使化學及材料科學的研究者們能更方便地建立三維結構模型,并對各種晶體、無定型以及高分子材料的性質及相關過程進行深入的研究。模擬的內容包括了催化劑、聚合物、固體及表面、晶體與衍射、化學反應等化學和材料研究領域的主要課題。包括如下功能模塊:Materials Visualizer、Discover、COMPASS、Amorphous Cell、Reflex、Reflex Plus、Equilibria、DMol3、CASTEP。可完成對分子力學、凝聚態、無定形態、晶體材料、相圖等模擬。
2)Gaussian&Gaussview
高斯的功能包含計算過渡態能量和結構、鍵和反應能量、分子軌道、原子電荷和電勢、振動頻率、紅外和拉曼光譜、核磁性質、極化率和超極化率、熱力學性質、反應路徑,計算可以對體系的基態或激發態執行。還可以預測周期體系的能量、結構和分子軌道等。因此,Gaussian可以作為功能強大的計算工具用于研究許多化學領域的課題,例如取代基的影響、化學反應機理、勢能曲面和激發能等。常常與Gaussview連用。
3)Gaussview
主要用途有兩個:構建高斯的輸入文件和以圖的形式顯示高斯計算的結果。除了可以自己構建輸入文件外,Gaussview還可讀入CHEM3D,HYPERCHEM和晶體數據等諸多格式的文件。從而使其可以與多種圖形軟件連用,大大拓寬了使用范圍。
4)ChemDraw
ChemDraw作為ChemBioOffice核心工具之一,提供了一套完整的繪圖解決方案,包括繪制化學結構及反應式,并且可以獲得相應的屬性數據、系統命名及光譜數據。利用ChemDraw可以準確處理和描繪有機材料、有機金屬、聚合材料和生物聚合物(包括氨基酸、肽、DNA及RNA序列等),以及處理立體化學等高級形式。能夠預先識別可能具有所需屬性的化合物,再進行實際合成,從而達到節省時間和降低成本的目的。類似的繪圖軟件還有KingDraw,該軟件有手機端APP可供下載。
5)Origin
Origin是一個科學繪圖、數據分析軟件,Origin支持各種各樣的2D/3D圖形。Origin中的數據分析功能包括統計、信號處理、曲線擬合以及峰值分析。Origin具有強大的數據導入功能,支持多種格式的數據,包括ASCII、Excel、NI TDM、DIADem、NetCDF、SPC等。圖形輸出格式多樣,例如JPEG,GIF,EPS,TIFF等,理工學科較多使用。
6)PyMOL
PyMOL是一個分子三維結構顯示軟件。PyMOL適用于創作高品質的小分子或是生物大分子(特別是蛋白質)的三維結構圖像。
7)MestReNova
MestReNova是一款核磁共振和液相色譜/氣相色譜/質譜數據處理、可視化模擬和預測的工具,多用于解譜工作。
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