寫作化學(xué)論文，少不了要作圖，尤其是發(fā)表對圖表要求篇幅比較長的期刊。然而，用什么軟件做的三維結(jié)構(gòu)圖才能高質(zhì)量地展現(xiàn)真實(shí)的晶體結(jié)果或數(shù)據(jù)，依舊是個大難題。本文推薦7個化學(xué)論文的作圖軟件。
1)Materials Studio
Materials Studio是專門為化學(xué)、材料科學(xué)領(lǐng)域研究者開發(fā)的一款可運(yùn)行在電腦端的模擬軟件，使化學(xué)及材料科學(xué)的研究者們能更方便地建立三維結(jié)構(gòu)模型，并對各種晶體、無定型以及高分子材料的性質(zhì)及相關(guān)過程進(jìn)行深入的研究。模擬的內(nèi)容包括了催化劑、聚合物、固體及表面、晶體與衍射、化學(xué)反應(yīng)等化學(xué)和材料研究領(lǐng)域的主要課題。包括如下功能模塊：Materials Visualizer、Discover、COMPASS、Amorphous Cell、Reflex、Reflex Plus、Equilibria、DMol3、CASTEP。可完成對分子力學(xué)、凝聚態(tài)、無定形態(tài)、晶體材料、相圖等模擬。
2)Gaussian&Gaussview
高斯的功能包含計(jì)算過渡態(tài)能量和結(jié)構(gòu)、鍵和反應(yīng)能量、分子軌道、原子電荷和電勢、振動頻率、紅外和拉曼光譜、核磁性質(zhì)、極化率和超極化率、熱力學(xué)性質(zhì)、反應(yīng)路徑，計(jì)算可以對體系的基態(tài)或激發(fā)態(tài)執(zhí)行。還可以預(yù)測周期體系的能量、結(jié)構(gòu)和分子軌道等。因此，Gaussian可以作為功能強(qiáng)大的計(jì)算工具用于研究許多化學(xué)領(lǐng)域的課題，例如取代基的影響、化學(xué)反應(yīng)機(jī)理、勢能曲面和激發(fā)能等。常常與Gaussview連用。
3)Gaussview
主要用途有兩個：構(gòu)建高斯的輸入文件和以圖的形式顯示高斯計(jì)算的結(jié)果。除了可以自己構(gòu)建輸入文件外，Gaussview還可讀入CHEM3D，HYPERCHEM和晶體數(shù)據(jù)等諸多格式的文件。從而使其可以與多種圖形軟件連用，大大拓寬了使用范圍。
4)ChemDraw
ChemDraw作為ChemBioOffice核心工具之一，提供了一套完整的繪圖解決方案，包括繪制化學(xué)結(jié)構(gòu)及反應(yīng)式，并且可以獲得相應(yīng)的屬性數(shù)據(jù)、系統(tǒng)命名及光譜數(shù)據(jù)。利用ChemDraw可以準(zhǔn)確處理和描繪有機(jī)材料、有機(jī)金屬、聚合材料和生物聚合物(包括氨基酸、肽、DNA及RNA序列等)，以及處理立體化學(xué)等高級形式。能夠預(yù)先識別可能具有所需屬性的化合物，再進(jìn)行實(shí)際合成，從而達(dá)到節(jié)省時間和降低成本的目的。類似的繪圖軟件還有KingDraw，該軟件有手機(jī)端APP可供下載。
5)Origin
Origin是一個科學(xué)繪圖、數(shù)據(jù)分析軟件，Origin支持各種各樣的2D/3D圖形。Origin中的數(shù)據(jù)分析功能包括統(tǒng)計(jì)、信號處理、曲線擬合以及峰值分析。Origin具有強(qiáng)大的數(shù)據(jù)導(dǎo)入功能，支持多種格式的數(shù)據(jù)，包括ASCII、Excel、NI TDM、DIADem、NetCDF、SPC等。圖形輸出格式多樣，例如JPEG，GIF，EPS，TIFF等，理工學(xué)科較多使用。
6)PyMOL
PyMOL是一個分子三維結(jié)構(gòu)顯示軟件。PyMOL適用于創(chuàng)作高品質(zhì)的小分子或是生物大分子(特別是蛋白質(zhì))的三維結(jié)構(gòu)圖像。
7)MestReNova
MestReNova是一款核磁共振和液相色譜/氣相色譜/質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理、可視化模擬和預(yù)測的工具，多用于解譜工作。
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